Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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GPS1Q13098 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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GPS1Q13098 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
GPS1Q13098 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPS1Q13098 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
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