Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GRIK3Q13003 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GRIK3Q13003 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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