Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GRIK2Q13002 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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