Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PTP4A2Q12974 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTP4A2Q12974 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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