Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
FOXD4Q12950 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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