Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PTPN13Q12923 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PTPN13Q12923 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PTPN13Q12923 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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PTPN13Q12923 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
PTPN13Q12923 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
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