Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
RIPPLY1Q0D2K3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms