Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
C2orf54Q08AI8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms