Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ITIH3Q06033 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms