Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ERCC6Q03468 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 MIR1227-201ENST00000408484 88 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ERCC6Q03468 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
ERCC6Q03468 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ERCC6Q03468 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ERCC6Q03468 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC27.51■■■□□ 2
ERCC6Q03468 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ERCC6Q03468 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ERCC6Q03468 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms