Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BNC1Q01954 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BNC1Q01954 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms