Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
DEFA6Q01524 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
DEFA6Q01524 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms