Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CACNA1BQ00975 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CACNA1BQ00975 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms