Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
HERVK_113P63132 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms