Protein–RNA interactions for Protein: P56645

PER3, Period circadian protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PER3P56645 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PER3P56645 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PER3P56645 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PER3P56645 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms