Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AQP4P55087 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AQP4P55087 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AQP4P55087 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms