Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RAD23AP54725 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms