Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EFNA3P52797 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms