Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
TTPAP49638 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
TTPAP49638 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TTPAP49638 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
TTPAP49638 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TTPAP49638 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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