Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ME1P48163 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ME1P48163 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ME1P48163 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ME1P48163 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ME1P48163 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ME1P48163 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ME1P48163 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ME1P48163 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ME1P48163 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ME1P48163 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ME1P48163 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ME1P48163 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ME1P48163 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ME1P48163 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms