Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
CDKN1BP46527 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms