Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RECQLP46063 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
RECQLP46063 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms