Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KDM5CP41229 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KDM5CP41229 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms