Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LTBRP36941 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
LTBRP36941 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBRP36941 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBRP36941 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBRP36941 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBRP36941 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBRP36941 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBRP36941 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBRP36941 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LTBRP36941 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms