Protein–RNA interactions for Protein: P32320

CDA, Cytidine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAP32320 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CDAP32320 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CDAP32320 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDAP32320 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDAP32320 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDAP32320 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDAP32320 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDAP32320 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDAP32320 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDAP32320 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
CDAP32320 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms