Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HLA-FP30511 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms