Protein–RNA interactions for Protein: P29084

GTF2E2, Transcription initiation factor IIE subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E2P29084 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2E2P29084 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms