Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PTX3P26022 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PTX3P26022 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PTX3P26022 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PTX3P26022 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms