Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
MATN1P21941 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
MATN1P21941 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MATN1P21941 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms