Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM21P19474 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM21P19474 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms