Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2CP19387 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms