Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SMPD1P17405 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SMPD1P17405 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms