Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EPCAMP16422 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms