Protein–RNA interactions for Protein: P14222

PRF1, Perforin-1, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRF1P14222 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PRF1P14222 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PRF1P14222 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms