Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CDH1P12830 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDH1P12830 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CDH1P12830 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CDH1P12830 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CDH1P12830 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms