Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ODC1P11926 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ODC1P11926 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ODC1P11926 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ODC1P11926 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ODC1P11926 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODC1P11926 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms