Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SFTPCP11686 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SFTPCP11686 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SFTPCP11686 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SFTPCP11686 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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SFTPCP11686 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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SFTPCP11686 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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SFTPCP11686 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SFTPCP11686 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
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