Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
C8orf89P0DMQ9 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms