Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RGPD1P0DJD0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms