Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ITGA10O75578 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms