Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CTNSO60931 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNSO60931 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNSO60931 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNSO60931 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CTNSO60931 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CTNSO60931 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CTNSO60931 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNSO60931 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CTNSO60931 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CTNSO60931 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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CTNSO60931 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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CTNSO60931 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTNSO60931 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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