Protein–RNA interactions for Protein: O43679

LDB2, LIM domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB2O43679 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
LDB2O43679 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
LDB2O43679 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LDB2O43679 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms