Protein–RNA interactions for Protein: O43196

MSH5, MutS protein homolog 5, humanhuman

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Length 834 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSH5O43196 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MSH5O43196 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSH5O43196 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MSH5O43196 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 MDH1-215ENST00000539945 1443 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 USMG5-205ENST00000369825 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 TIMM23B-201ENST00000374098 1142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AL031186.1-201ENST00000433125 385 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 ID2-AS1-207ENST00000455965 794 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AC137735.1-201ENST00000581911 419 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MSH5O43196 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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MSH5O43196 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
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MSH5O43196 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
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MSH5O43196 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 AL390036.1-203ENST00000635340 894 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MSH5O43196 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MSH5O43196 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
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