Protein–RNA interactions for Protein: O15230

LAMA5, Laminin subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 3,695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5O15230 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LAMA5O15230 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LAMA5O15230 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LAMA5O15230 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA5O15230 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA5O15230 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA5O15230 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA5O15230 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA5O15230 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA5O15230 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA5O15230 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
LAMA5O15230 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAMA5O15230 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAMA5O15230 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAMA5O15230 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAMA5O15230 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
LAMA5O15230 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms