Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM6BO15054 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms