Protein–RNA interactions for Protein: O14595

CTDSP2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2O14595 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CTDSP2O14595 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms