Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
EBAG9O00559 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms