Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPB9F8W1W9 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPB9F8W1W9 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms