Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

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Length 899 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRRT4C9JH25 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
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