Protein–RNA interactions for Protein: C9J069

C9orf172, Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172C9J069 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
C9orf172C9J069 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
C9orf172C9J069 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms